I ricercatori dell\u2019Istituto di Biomembrane, Bioenergetica e Biotecnologie molecolari del Consiglio Nazionale delle Ricerche (Cnr-IBIOM) di Bari, dell\u2019Universit\u00e0 Aldo Moro di Bari e del Dipartimento di Bioscienze dell\u2019Universit\u00e0 degli Studi di Milano hanno sviluppato un software per facilitare l\u2019analisi del genoma del coronavirus SARS-CoV-2, l\u2019agente patogeno che causa il COVID-19.<\/p>\n
Lo studio \u00e8 stato\u00a0pubblicato su Bioinformatics<\/a>, in un articolo dove viene specificato come durante la pandemia sono state sequenziate e rese disponibili oltre 400 mila sequenze genomiche appartenenti a differenti ceppi del virus identificate in diverse zone del mondo: una ricchezza di dati che per\u00f2 ha generato anche problemi in termini di analisi, in relazione alla loro enorme quantit\u00e0.<\/p>\n Per rispondere a questa esigenza gli autori dello studio hanno sviluppato\u00a0CorGAT (Coronavirus Genome Analysis Tool), uno strumento dotato di\u00a0un\u2019interfaccia web che ne facilita l\u2019utilizzo, accessibile a tutta la comunit\u00e0 scientifica. A oggi, sottolinea Graziano Pesole\u00a0del CNR-IBIOM, \u201cCorGAT \u00e8 probabilmente il pi\u00f9 aggiornato e accurato sistema per eseguire questo tipo di analis<\/em>i\u201d, dato che \u201c\u00e8 stato sviluppato per incorporare la maggiore quantit\u00e0 di informazioni possibile e integra una serie di risorse e sistemi originali per l\u2019annotazione del genoma<\/em>\u201d.<\/p>\n Applicando CorGAT a pi\u00f9 di 50 mila sequenze genomiche, gli autori dello studio sono stati in grado di delineare le dinamiche evolutive di SARS-CoV-2 e di individuare le regioni del genoma che accumulano pi\u00f9 mutazioni.<\/p>\n La rapida identificazione di ceppi virali emergenti o di varianti genetiche potenzialmente associate a nuove caratteristiche \u00e8 uno degli obiettivi pi\u00f9 importanti della sorveglianza genomica – lo studio del genoma dei patogeni – e si applica, ad esempio, per l\u2019identificazione e caratterizzazione delle cosiddette nuove varianti del virus.<\/p>\n CorGAT e strumenti simili, applicati su larga scala, potranno facilitare lo studio dei possibili effetti delle nuove varianti nel genoma di SARS-CoV-2, contribuendo indirettamente anche alla progettazione di farmaci e vaccini.<\/p>\n CorGAT<\/a> \u00e8 liberamente accessibile ed \u00e8 aggiornato costantemente, per offrire informazioni sempre pi\u00f9 accurate e precise. Lo strumento \u00e8 stato realizzato con il supporto di una piattaforma cloud, Laniakea<\/a>, resa disponibile dalla Computer Platform del nodo italiano dell\u2019Infrastruttura di ricerca europea ELIXIR per le Scienze della vita, coordinata dal CNR sotto la responsabilit\u00e0 di Pesole.s<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" I ricercatori dell\u2019Istituto di Biomembrane, Bioenergetica e Biotecnologie molecolari del Consiglio…<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":12606,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"inline_featured_image":false,"footnotes":""},"categories":[44],"tags":[250,364,292],"class_list":["post-12605","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-news","tag-covid-19","tag-digital-data","tag-genoma"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/lombardialifesciences.it\/en\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/12605","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/lombardialifesciences.it\/en\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/lombardialifesciences.it\/en\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/lombardialifesciences.it\/en\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/lombardialifesciences.it\/en\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=12605"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/lombardialifesciences.it\/en\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/12605\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":17375,"href":"https:\/\/lombardialifesciences.it\/en\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/12605\/revisions\/17375"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/lombardialifesciences.it\/en\/wp-json\/wp\/v2\/media\/12606"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/lombardialifesciences.it\/en\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=12605"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/lombardialifesciences.it\/en\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=12605"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/lombardialifesciences.it\/en\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=12605"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}