L’Agenzia è incaricata della gestione finanziaria del nuovo programma EU4Health (5,1 miliardi), del Programma per il Mercato Unico per la sicurezza alimentare (1,3 miliardi), del programma Digital Europe (0,8 miliardi), del Connecting Europe Facility Digital (1,7 miliardi), oltre che dei Cluster Salute (5,4 miliardi) e Digital, Industry and Space, del programma Horizon Europe.
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